Catan Junior mantém a mesma mecânica de negociação que o Catan Básico e está adaptado para poder jogar facilmente com crianças e iniciar a sua carreira no mundo dos jogos de tabuleiro. Com um cenário de pirata, os jogadores colocam covis num anel de ilhas e constroem navios para obter materiais de outras ilhas. Em cada turno, pode construir um navio, obter ajuda do Coco, o papagaio, para grandes recompensas ou construir um covil. O primeiro jogador a controlar 7 covis é o vencedor. Em cada jogada, um jogador é o capitão, começando pelo jogador mais jovem. O capitão lançará os dados e determinará quais fichas "disto e aquilo" serão distribuídas aos jogadores. Então o capitão, na ordem que desejar, pode construir covis e navios, bem como pedir ajuda ao Coco. Se não tiver as fichas necessárias, pode alternar entre “disto e aquilo”. Então, o jogador à sua esquerda será o novo capitão. Cuidado com o Pirata Rapina, que pode estragar os seus planos! Na versão Junior, o Pirata Rapina funciona como o ladrão no Catan Básico, mas de uma forma mais suave. Quando um 6 é lançado como resultado da jogada do dado, o Pirata Rapina não rouba, mas apenas bloqueia a geração de recursos. Tem que gerar os seus recursos de madeira, ananases, ovelhas, sabres e ouro para vencer. Nesta versão Junior, os recursos são fichas mais fáceis de manusear pelos mais pequenos. Para criar um navio, precisa de madeira e lã de ovelha, mas para criar um covil deve ter esses dois recursos, mais um sabre e um ananás. Os turnos de Catan Junior funcionam da mesma forma que no Catan básico, que joga os dados, gerando os recursos que pode trocar com os outros jogadores e no final do seu turno decide se quer construir ou comprar ajuda do Papagaio Coco. Embora Catan Junior seja perfeitamente adequado para jogadores mais jovens, na verdade é um jogo para toda a família. Este jogo gera diversão para jogadores de todas as idades, pois embora seja simplificado, tem o que faz de Catan um jogo de sucesso mundial: alta interação entre jogadores e rejogabilidade. Cada jogo de Catan Junior será diferente, o que torna este jogo repetível inúmeras vezes.
