Em 1503 Sandro Botticelli pede ajuda ao seu amigo Leonardo. A situação é desesperada: os herdeiros da Linhagem Sagrada caíram nas mãos do temível César Bórgia. Da Vinci porá o seu génio ao serviço do resgato dos herdeiros e do prevalecimento da justiça... Séculos mais tarde, o reinado do terror de Robespierre será o enquadramento histórico para uma nova perseguição que remeterá para o oblívio os herdeiros. No entanto, em plena Segunda guerra mundial, um investigador descobre no norte da França o rasto perdido e a sua relação com o artista Leonardo. E a neta desta misteriosa personagem está determinada a acabar uma procura que encerra as chaves do maior secreto da Cristandade.
A meio caminho entre o relato de factos históricos e a história romanceada, esta narração penetra nos mistérios da Linhagem Sagrada ao longo de cinco séculos de história do Ocidente. Uma trepidante história que abarca desde o renascimento, com paragens na Revolução Francesa e na Segunda Guerra Mundial, e que culmina de maneira surpreendente no recinto do Vale dos Caídos.
O Diário Secreto de Da Vinci é um inquietante relato de mistérios, aventuras, intrigas e paixões, que segue os passos da dinastia de Jesus e revela a sua sobrevivência até aos nossos dias.